药物成分方面
金霉素眼膏主要成分是金霉素，属于四环素类抗生素；红霉素眼膏主要成分是红霉素，属于大环内酯类抗生素。
抗菌谱方面
金霉素眼膏对多种革兰阳性菌及沙眼衣原体等有抑制作用；红霉素眼膏对革兰阳性菌，如金黄色葡萄球菌、链球菌等有较强的抗菌作用，对部分革兰阴性菌也有一定抗菌活性，对支原体、衣原体等也有作用。
适应证方面
金霉素眼膏可用于治疗细菌性结膜炎、麦粒肿及细菌性眼睑炎，也用于治疗沙眼；红霉素眼膏适用于沙眼、结膜炎、角膜炎，也用于预防新生儿淋球菌及沙眼衣原体眼部感染。
不良反应方面
金霉素眼膏偶尔可能引起眼部刺激，如灼烧感、红肿等；红霉素眼膏不良反应较少，偶尔有眼部刺激感，偶见过敏反应。
特殊人群注意事项
孕妇及哺乳期妇女：两者使用时均需谨慎，应在医生指导下权衡利弊后使用，因为药物可能通过局部吸收进入体内影响胎儿或婴儿。
儿童：儿童使用时需格外小心，应在成人监护下使用，避免药物进入眼内引起不适等情况，由于儿童眼部发育尚未完全成熟，用药更需谨慎评估。