12岁女孩来月经12天是不正常的，可能与以下原因有关。
下丘脑-垂体-卵巢轴功能尚未健全：女孩在12岁时，下丘脑-垂体-卵巢轴的功能尚未完全发育成熟，这可能导致激素分泌异常，从而使月经周期不规律。
情绪因素：女孩在月经初潮时，可能会因为对月经的陌生而产生紧张、焦虑、恐惧等情绪，这些情绪可能会影响大脑皮层的功能，导致下丘脑-垂体-卵巢轴的功能紊乱，从而引起月经失调。
生活习惯：女孩在月经期间，如果不注意保暖、过度劳累、剧烈运动、饮食不规律等，也可能会导致月经失调。
其他：一些全身性疾病，如血液病、甲状腺功能亢进等，也可能会导致月经失调。
对于12岁女孩的这种情况，家长应该引起重视，及时带孩子去医院就诊，进行相关的检查，如性激素六项、B超等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长也应该给孩子提供心理支持，帮助孩子缓解紧张、焦虑等情绪，让孩子保持良好的生活习惯。