两边太阳穴疼可能由血管性头痛、发烧、中枢神经系统感染等原因引起，其中血管性头痛与血管收缩功能障碍及三叉神经血管复合体病变有关，中枢神经系统感染需完善脑电图检查明确诊断，若该症状较严重或持续时间较长，应及时就医检查诊断并采取相应治疗措施。
两边太阳穴疼可能由以下原因引起：
1.血管性头痛：这是一种常见的头痛类型，与血管的收缩功能障碍有关。当血管出现异常扩张时，患者会出现双侧搏动性头痛，可能伴有恶心呕吐。这种疼痛与三叉神经血管复合体的病变也有一定相关性。
2.发烧：体温升高时，也可能导致两边太阳穴疼痛。
3.中枢神经系统感染：如病毒性脑炎患者可能出现此类症状。对于这种情况，需要完善脑电图检查以明确诊断。
需要注意的是，以上只是一些可能导致两边太阳穴疼的原因。如果出现这种症状，尤其是疼痛较为严重或持续时间较长时，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便确定具体原因并采取相应的治疗措施。