三个月半月大婴儿晚上睡觉摇头，可能与以下几种情况有关。
1.正常的生理现象：婴儿的神经系统发育尚未完善，睡眠时可能会出现不自主的摇头、四肢活动等，这是正常的生理现象，一般随着婴儿月龄的增长会逐渐消失。
2.环境因素：如果婴儿睡觉的环境温度过高、过低，或者被褥过厚、过薄，都可能导致婴儿感觉不适，从而出现摇头的现象。家长可以调整婴儿的睡眠环境，保持适宜的温度和湿度，选择合适的被褥。
3.湿疹：如果婴儿头部有湿疹，会导致瘙痒，从而引起婴儿摇头。家长可以观察婴儿的头部是否有皮疹、脱屑等，如果有湿疹，可以在医生的指导下给婴儿使用湿疹膏。
4.缺钙：维生素D缺乏性佝偻病的早期表现之一就是婴儿多汗、头部瘙痒，所以会出现摇头的现象。同时，婴儿还可能伴有夜惊、夜啼、烦躁、方颅、鸡胸等症状。家长可以带婴儿到医院检测维生素D和微量元素，如果有缺钙的情况，需要在医生的指导下补充钙剂和维生素D。
5.耳部感染：如果婴儿的耳部有感染，如中耳炎，会导致耳部疼痛，从而引起婴儿摇头。同时，婴儿还可能伴有哭闹、抓耳等症状。家长可以观察婴儿的耳部是否有红肿、分泌物等，如果有耳部感染，需要及时就医，在医生的指导下使用抗生素治疗。
总之，如果家长发现三个月半月大婴儿晚上睡觉总是摇头，需要密切观察婴儿的情况，如果伴有其他异常症状，或者摇头的情况持续不缓解，需要及时带婴儿到医院就诊，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。