牙齿最里面的肉肿起来，可能是由多种原因引起的，以下是一些常见的治疗方法：
1.智齿冠周炎：如果是智齿萌出不全或阻生，牙冠周围软组织发生的炎症，可导致牙龈肿胀、疼痛。在炎症初期，可局部冲洗、上药，同时口服抗生素，如甲硝唑、阿莫西林等。如果炎症严重，形成脓肿，需切开引流，并进行冠周冲洗。待炎症消退后，应考虑拔除智齿。
2.牙周炎：牙周炎可导致牙龈红肿、出血、牙周袋形成、牙槽骨吸收等。治疗方法包括口腔清洁、龈上洁治（洗牙）、龈下刮治等。此外，还需定期复查，维护口腔健康。
3.根尖周炎：牙髓炎发展到晚期，细菌可通过根尖孔引起根尖周炎，导致牙龈肿痛。治疗方法主要是根管治疗，即去除根管内的感染物质，进行根管消毒和充填。
4.牙龈乳头炎：食物嵌塞、过硬的食物刺伤等可引起牙龈乳头炎，导致牙龈乳头红肿、疼痛。治疗方法是去除局部刺激因素，如清除食物残渣、改正刷牙方法等，同时局部使用抗菌消炎药物，如碘甘油。
5.其他原因：牙龈瘤、口腔肿瘤等也可能导致牙龈肿胀。如果牙龈肿胀持续不缓解或伴有其他症状，如疼痛加剧、发热、张口受限等，应及时就医，进行详细的口腔检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据个人情况而定。在治疗过程中，应保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物，戒烟戒酒。同时，应按照医生的建议进行治疗和复诊，以促进牙龈的恢复和口腔健康的维护。