三个月的宝宝拉肚子，可能是以下原因引起的：
1.饮食问题：宝宝的消化系统尚未完全发育成熟，可能对某些食物过敏或不耐受，如牛奶、蛋白质等。此外，过度喂养、过早添加辅食等也可能导致宝宝拉肚子。
2.感染：宝宝可能感染了病毒、细菌或寄生虫，如轮状病毒、大肠杆菌等，这些感染会引起肠道炎症，导致拉肚子。
3.肠道菌群失衡：宝宝的肠道菌群尚未完全建立，容易受到外界因素的影响，如抗生素的使用、环境中的细菌感染等，导致肠道菌群失衡，引起拉肚子。
4.其他原因：宝宝可能患有乳糖不耐受、炎症性肠病等疾病，也会导致拉肚子。
针对宝宝拉肚子的情况，可以采取以下措施：
1.调整饮食：如果是母乳喂养的宝宝，妈妈可以调整饮食，避免食用油腻、辛辣、刺激性食物；如果是人工喂养的宝宝，可以考虑更换奶粉品牌或调整奶粉浓度。
2.补充水分：宝宝拉肚子可能会导致脱水，因此需要及时补充水分。可以给宝宝喝适量的白开水、口服补液盐溶液等。
3.注意腹部保暖：宝宝的腹部容易受凉，导致拉肚子加重，可以给宝宝使用热水袋或暖宝宝等保暖。
4.服用药物：如果宝宝拉肚子的情况比较严重，可以在医生的指导下服用蒙脱石散、双歧杆菌四联活菌片等药物进行治疗。
5.就医治疗：如果宝宝拉肚子的情况持续时间较长或伴有其他症状，如发热、呕吐、腹痛等，应及时就医，进行相关检查和治疗。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，如果对宝宝的拉肚子情况有任何疑问，应及时咨询医生的意见。同时，在给宝宝服用药物时，应按照医生的建议使用，避免自行增减剂量。