有时吞咽困难可能由多种原因引起。比如，约有10%的健康人可能偶尔会出现短暂的吞咽困难情况，但如果经常发生就要重视了。
一、咽部疾病导致吞咽困难
咽部炎症： 像急性咽炎、急性扁桃体炎等，炎症会使咽部黏膜充血、肿胀，吞咽时会感到疼痛且有梗阻感。例如，急性咽炎发作时，患者咽部会明显疼痛，吞咽时疼痛加剧，可能还伴有发热等症状。咽部异物： 如果有鱼刺、骨头等异物卡在咽部，会直接导致吞咽困难，而且能明确感觉到异物所在位置，吞咽时异物感强烈。
二、食管疾病引发吞咽困难
食管炎症： 反流性食管炎比较常见，胃酸反流刺激食管黏膜，引起食管炎症、水肿，导致吞咽困难。一般在进食后尤其是平卧时更容易出现，还可能伴有烧心、反酸等症状。食管狭窄： 比如食管良性狭窄，可能是由于食管化学烧伤、食管憩室等引起，食管腔变窄后，食物通过受阻，吞咽困难会逐渐加重。还有食管癌，早期可能只是吞咽粗硬食物时有不同程度的不适感觉，像哽噎感等，中晚期则会进行性吞咽困难，从难咽干的食物发展到难咽流质食物。
三、神经肌肉病变造成吞咽困难
延髓麻痹： 多见于脑血管意外、脑炎等疾病，会影响吞咽的神经支配，导致吞咽肌肉运动不协调，出现吞咽困难，同时可能伴有饮水呛咳、言语不清等症状。重症肌无力： 这是一种自身免疫性疾病，主要是神经肌肉接头传递功能障碍，患者会出现吞咽困难、咀嚼无力等症状，而且症状具有波动性，疲劳后加重，休息后减轻。
四、精神心理因素导致的吞咽困难
癔症性吞咽困难： 多见于青年女性，往往是在精神受到刺激后发病，吞咽困难时轻时重，没有器质性的食管病变基础，但会严重影响患者的进食情况，不过一般不影响唾液的吞咽。