子宫内膜异位症的发生与多种因素相关。目前认为，经血逆流种植是主要原因之一，据统计，约有10% - 15%的女性存在经血逆流情况，但其中只有部分人会发展为子宫内膜异位症。
经血逆流种植因素
经期宫腔操作影响： 女性在经期进行宫腔手术，如剖宫产、人工流产等，可能会增加经血逆流的风险，使得子宫内膜组织随着经血逆流到盆腔等部位并种植生长。比如有过剖宫产史的女性，子宫内膜组织有更多机会种植到手术切口等位置。盆腔解剖结构异常： 一些女性盆腔解剖结构存在异常，像先天性生殖道畸形等情况，会影响经血正常排出，进而促使经血逆流。例如处女膜闭锁的女性，经血无法正常排出，更容易发生经血逆流导致子宫内膜异位。
免疫调节异常因素
自身免疫功能缺陷： 人体自身免疫系统对异位的子宫内膜组织不能正常识别和清除，就会导致子宫内膜异位症的发生。研究发现，子宫内膜异位症患者体内的免疫细胞功能存在一定异常，不能有效发挥对异位内膜的免疫监视作用。细胞因子失衡： 体内细胞因子的平衡被打破也与子宫内膜异位症有关。例如某些细胞因子会促进子宫内膜细胞的种植、黏附和生长，而抑制其凋亡的细胞因子减少，使得异位的子宫内膜组织能够存活并生长形成病灶。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 子宫内膜异位症具有一定的遗传易感性，如果家族中有亲属患有该病，那么女性患病的风险会增加。研究表明，遗传因素可能通过影响相关基因的表达等方式，使个体更容易发生子宫内膜异位症。比如母亲患有子宫内膜异位症，女儿患病的几率比正常人群要高一些。基因变异相关： 某些特定基因的变异与子宫内膜异位症的发生相关。例如与细胞黏附、激素代谢等相关的基因发生变异时，会增加患子宫内膜异位症的可能性。目前已经发现多个与子宫内膜异位症发病相关的基因位点。