子宫内膜异位症的发生与多种因素相关。目前认为，遗传因素是其中一个重要方面，约15%的子宫内膜异位症患者有家族史，一级亲属患病时，本人患病风险会增加。
遗传因素相关
家族遗传倾向： 如果家族中有女性患有子宫内膜异位症，那么其他女性成员患病的风险相对较高。研究发现，遗传因素可能通过影响免疫系统、激素调节等方面，增加子宫内膜异位症的发病几率。
经血逆流因素
经血逆流机制： 女性在月经期间，子宫内膜组织可能会通过输卵管逆流进入盆腔。正常情况下，这些逆流的内膜组织会被人体免疫系统清除，但如果免疫系统出现异常，就可能导致内膜组织在盆腔内种植、生长，从而引发子宫内膜异位症。例如，有先天性生殖道畸形导致经血排出不畅的女性，经血逆流的概率增加，患病风险也相应提高。
免疫调节因素
免疫系统异常影响： 人体的免疫系统在维持内环境稳定中起着重要作用。当免疫系统出现缺陷时，无法有效清除盆腔内逆流的子宫内膜组织，使得内膜组织得以在局部生长、蔓延，进而发展为子宫内膜异位症。比如，一些患有自身免疫性疾病的女性，其免疫系统本就处于异常状态，更容易发生子宫内膜异位症。
激素影响因素
雌激素的作用： 雌激素对子宫内膜的生长有促进作用。子宫内膜异位症病灶会受到雌激素的影响而生长、增殖，形成异位的内膜组织。在月经周期中，雌激素水平的变化会刺激异位内膜组织发生周期性出血等改变，进一步加重病情。例如，长期雌激素水平过高的女性，患子宫内膜异位症的风险可能会增加。