关键点：睡觉起来眼睛疼可能与睡眠不足、物理刺激、结膜炎等因素有关，还可能与角膜炎、干眼症等因素有关，需进一步检查确诊。
一、睡眠不足：若平时长期熬夜，致使睡眠时间较短，就容易引发眼部疲劳，进而导致眼部干涩、疼痛。因为睡眠不足时，眼部肌肉得不到充分的休息和放松，会使其处于紧张状态，久而久之便会出现这些不适症状。
二、物理刺激：当眼部进入灰尘、风沙等物质时，会对眼部组织形成刺激，从而产生轻微疼痛感。这些外来物会刺激眼部的敏感部位，引起眼部的不适反应。
三、结膜炎：结膜炎是结膜组织的常见炎症性疾病，其产生可能与感染、个人免疫病变等因素相关，会使眼睛出现红肿、分泌物增多等情况。感染可能来自细菌、病毒等，而个人免疫病变也可能诱发结膜炎。
此外，角膜炎、干眼症等因素也可能导致睡觉起来眼睛疼，所以需要到眼科做进一步的详细检查来明确具体原因。
总之，睡觉起来眼睛疼的原因多样，需要仔细排查和诊断，以便采取合适的应对措施。