肠结核是由结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，其症状表现多样。一般来说，患者可能会出现腹痛、腹泻与便秘交替、全身症状等。
腹痛表现
右下腹疼痛： 肠结核好发于回盲部，所以多数患者会出现右下腹疼痛，疼痛性质多为隐痛或钝痛，有时在进食后会加重，这是因为进食会引起胃肠蠕动增加，刺激病变部位。疼痛与排便关系： 部分患者可能会有疼痛 - 排便的关系，比如在排便前疼痛加剧，排便后可稍有缓解，但这种表现不是所有患者都有。
肠道功能紊乱表现
腹泻： 是肠结核常见症状之一，每日排便次数可在2 - 10次不等，粪便多为糊状，一般无脓血，若是病变严重累及结肠，可能会有黏液脓血便，但相对较少见。便秘： 与腹泻可交替出现，当病变引起肠管狭窄时，会出现便秘症状，表现为大便干结、排便困难等。
全身症状表现
发热： 多数患者有低热，体温一般在37.5℃ - 38.5℃之间，午后低热较为常见，部分患者可出现弛张热或稽留热。盗汗： 患者在夜间或睡醒时会有出汗现象，也就是盗汗，严重时可湿透衣物。消瘦、乏力： 由于结核分枝杆菌感染是慢性消耗性过程，患者会出现消瘦，体重逐渐下降，同时伴有乏力，影响日常生活和工作。
腹部体征表现
腹部压痛： 右下腹常有固定的压痛，按压时可感觉到疼痛，但压痛程度因人而异。腹部肿块： 部分患者可在右下腹触及肿块，质地中等，比较固定，伴有轻度或中度压痛，多见于增生型肠结核。