胃肠神经官能症的治疗需综合多方面因素，一般可通过心理调节、药物辅助等方式改善，其中心理治疗在病程较长（可能持续数周甚至数月）的患者中较为关键。
心理调节很重要
情绪管理：患者要尽量保持心情舒畅，避免长期处于焦虑、紧张、抑郁等不良情绪中。可以通过听舒缓的音乐、做深呼吸等方式来放松自己，每天坚持15 - 30分钟的放松练习有助于缓解症状。认知调整：正确认识疾病，了解胃肠神经官能症是一种功能性胃肠疾病，并非器质性病变，不要过度担忧。通过学习相关健康知识，树立战胜疾病的信心，这对病情的好转有积极作用。
药物辅助缓解症状
调节胃肠动力药物：如果出现腹胀、早饱等胃肠动力不足的症状，可使用多潘立酮等药物。多潘立酮能促进胃肠蠕动，一般可在饭前15 - 30分钟服用，帮助改善胃肠动力相关问题。调节神经的药物：对于伴有明显精神症状，如失眠、焦虑的患者，可使用谷维素等药物。谷维素能调节植物神经功能，通常每次服用10 - 20毫克，每日3次，有助于改善神经功能紊乱状况。
饮食调理不可忽视
规律进食：每天要定时定量进餐，避免暴饮暴食，一般可分为3 - 4餐。例如早餐在7 - 8点，午餐在11 - 12点，下午加餐在15点左右，晚餐在18 - 19点，保持胃肠消化的规律性。避免刺激性食物：要减少食用辛辣、油腻、生冷等刺激性食物，如辣椒、油炸食品、冰镇饮料等。这些食物容易刺激胃肠黏膜，加重胃肠神经官能症的不适症状，建议日常饮食以清淡、易消化的食物为主，如米粥、面条、软米饭等。