治口腔溃疡的药有局部用药和全身用药等。一般来说，局部用药较为常用，能较快缓解症状。
局部用药缓解疼痛
口腔溃疡散类：这类药物有清热敛疮的作用，直接撒在溃疡面上，能促进溃疡愈合，一般用药后几分钟内可能会感觉疼痛有所减轻，使用方便。西瓜霜喷剂：主要成分是西瓜霜、硼砂等，具有消肿止痛、促进溃疡愈合的功效，喷于患处，一天可使用数次，能缓解口腔溃疡带来的疼痛，加速溃疡面修复。
促进愈合的药物
重组人表皮生长因子凝胶：它能促进皮肤与黏膜创面组织修复过程中的DNA、RNA和羟脯氨酸的合成，加速创面肉芽组织生成和上皮细胞增殖，从而缩短创面愈合时间。使用时取适量凝胶涂于患处，每日一次即可。康复新液：可通利血脉，养阴生肌。内服时能治疗瘀血阻滞，胃痛出血，胃、十二指肠溃疡；外用能冲洗创面，或用浸透药液的纱布敷用在患处，能促进口腔溃疡创面的愈合。
缓解炎症的药物
含漱液类：氯己定含漱液，它能有效抑制口腔内的细菌，减少炎症，一般一次含漱10 - 15毫升，早晚各一次，连续使用不超过一周。西地碘含片：主要成分是分子碘，在唾液作用下迅速释放出碘，可直接卤化菌体蛋白质，杀灭各种微生物，对口腔溃疡引起的炎症有一定的缓解作用，一次含服1片，一日3 - 5次。
全身用药针对病因
如果是因缺乏维生素引起的口腔溃疡，可适当补充维生素类药物，如复合维生素B片，它含有多种B族维生素，能参与体内糖、蛋白质和脂肪的正常代谢，一般一次口服1 - 3片，一日3次，但长期服用可能会出现烦躁、疲倦、食欲缺乏等不良反应，需在医生指导下使用。如果是免疫力低下导致的口腔溃疡，可使用免疫调节剂，如转移因子胶囊，它可增强或抑制体液免疫和细胞免疫功能，但孕妇及哺乳期妇女用药需谨慎，应咨询医生后再决定是否使用。