小腹两边疼痛可能由多种原因引起。比如女性生理期时，约有60% - 90%的女性会出现小腹两边轻微疼痛，一般在月经来潮前1 - 2天开始，经期第1天疼痛最明显，持续2 - 3天后缓解。
妇科相关原因
盆腔炎： 女性盆腔内的器官发生炎症时可能导致小腹两边疼痛。急性盆腔炎除了小腹两边疼，还可能伴有发热，体温可达到38℃以上，同时有阴道分泌物增多且有异味等症状。慢性盆腔炎往往是急性盆腔炎未彻底治疗迁延而来，疼痛一般为隐痛，可能会反复发作，在劳累、性交后及月经前后加重。附件炎： 女性的附件包括输卵管和卵巢，附件发生炎症时会引起小腹两边疼痛。附件炎急性发作时疼痛较剧烈，可伴有寒战、高热等症状；慢性附件炎则表现为小腹隐痛、坠胀，常常在月经期前后加重，还可能影响生育，导致输卵管粘连、堵塞等情况。宫外孕： 宫外孕时，当受精卵在输卵管等部位着床发育，会引起小腹一侧或两边疼痛，通常还会伴有阴道不规则出血，出血量一般少于月经量，但如果是输卵管妊娠破裂，会出现大量腹腔内出血，表现为剧烈腹痛、头晕、乏力，甚至休克，这种情况非常危急，需要立即就医。
肠道相关原因
结肠炎： 结肠炎也可能导致小腹两边疼痛。例如溃疡性结肠炎，患者除了小腹两边疼痛，还会有腹泻，大便多为黏液脓血便，每天排便次数可达数次至十余次不等，同时可能伴有消瘦、乏力等全身症状。而慢性结肠炎一般是长期饮食不规律、肠道菌群失调等引起，疼痛多为隐痛、胀痛，腹泻症状相对较轻，可能在进食生冷、油腻食物后加重。肠痉挛： 多是由于饮食不当引起，比如吃了过多生冷的食物，导致肠道平滑肌强烈收缩，出现小腹两边阵发性疼痛，疼痛程度轻重不一，一般可自行缓解，也可以通过热敷腹部等方式缓解。
泌尿系统相关原因
输尿管结石： 当输尿管内有结石时，会引起小腹两边剧烈疼痛，这种疼痛往往呈绞痛性质，疼痛非常剧烈，难以忍受，还可能向会阴部放射，同时伴有血尿，尿液中可看到红色血丝或血块，患者还可能出现恶心、呕吐等症状。通过泌尿系统超声等检查可以发现输尿管内的结石。膀胱炎： 膀胱炎也可能导致小腹两边有疼痛感，同时伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，尿频表现为排尿次数明显增多，尿急是有尿意就迫不及待要排尿，尿痛是排尿时尿道有烧灼感，严重时可能会出现血尿。