导致睡一觉起来眼睛肿了的原因有很多，包括生理性原因和病理性原因。生理性原因主要有临睡前大量饮水或哭过后睡觉等，这种情况通常休息、冷敷后可好转。而如果休息后无好转，则多由某些疾病引起，建议就医检查诊断，具体如下：
一、眼部疾病：
1.在睡眠期间如果触碰了不干净的物品，或者使用被污染的手揉眼睛等，都可能感染眼睛，引发麦粒肿、细菌性结膜炎等眼部疾病。
二、过敏：
过敏会导致患者血管通透性增加，引起眼睛局部血管通透性升高，加上睡眠期间血液循环减慢，使得大量水分潴留于眼周，从而导致睡一觉起来眼睛肿了，同时可能伴有眼部不适。
三、肾脏疾病：
常见各种肾脏疾病，比如肾小球肾炎、肾病综合征，或者由糖尿病、高血压继发的肾功能不全等，这些都会消耗血液中的白蛋白。白蛋白减少后，会导致血液中的水分增多，进而出现睡一觉起来眼睛肿的情况。
四、心血管疾病：
常见心脏器质性疾病，如心力衰竭会导致全身血液循环异常，引起水钠潴留及静脉淤血，进而造成眼睛水肿。
五、肝脏疾病：
像肝炎、肝硬化等肝脏疾病可能会导致患者出现低蛋白血症，引起血液循环障碍从而造成眼睛等部位的肝源性水肿。
六、内分泌疾病：
甲减患者存在粘多糖代谢障碍并造成淤积，就会导致睡一觉起来眼睛水肿症状的出现。
总之，睡一觉起来眼睛肿的原因多样，需要根据具体情况进行分析和判断，必要时及时就医检查和治疗。