小孩长不高的原因有多种。其中遗传因素是比较重要的一点，如果父母身高偏矮，小孩遗传到相关基因，身高可能相对受限，据统计，遗传因素对身高的影响约占70%。
一、营养因素
营养摄入不足： 小孩处于生长发育阶段，需要充足的营养物质，如蛋白质、钙、维生素D等。如果日常饮食中缺乏这些营养，就会影响骨骼的生长发育。例如，长期摄入蛋白质含量低的食物，会导致身体缺乏构建骨骼和肌肉的原料。营养不均衡： 饮食中各种营养成分搭配不合理也会影响身高。比如钙的摄入不足，钙是骨骼发育的重要元素，儿童每天需要摄入足够的钙来保证骨骼正常生长，一般建议儿童每天钙的摄入量在800 - 1000毫克，如果长期达不到这个量，就会影响身高增长。
二、疾病因素
内分泌疾病： 像生长激素缺乏症，是由于垂体分泌生长激素不足导致的，会使小孩身高明显低于同龄人。甲状腺功能减退症也会影响身高，因为甲状腺激素能促进机体生长发育，甲状腺功能减退时，机体代谢减慢，生长发育也会受影响。慢性疾病： 一些慢性疾病也会阻碍小孩长高，例如先天性心脏病、慢性肾病等。慢性肾病会影响机体的代谢和营养吸收，进而影响骨骼生长；先天性心脏病会导致身体长期缺氧，影响生长发育所需的物质供应。
三、生活方式因素
睡眠不足： 小孩在睡眠时身体会分泌生长激素，促进骨骼生长。如果小孩长期睡眠不足，比如每天睡眠时间少于8 - 10小时，就会影响生长激素的分泌，从而影响身高增长。缺乏运动： 适当的运动可以刺激骨骼生长，像跳绳、打篮球等运动能促进骨骼的纵向生长。如果小孩长期缺乏运动，骨骼得不到有效的刺激，也会影响身高发育。