扁桃体发炎主要是由病原体感染引起的，其中细菌和病毒是常见的致病因素。比如A组乙型溶血性链球菌是引发扁桃体发炎较为常见的细菌病原体，而病毒方面，像腺病毒、鼻病毒等都可能导致扁桃体发炎，儿童时期扁桃体发炎的发生率相对较高，约占儿童上呼吸道感染的10% - 15%左右。
病原体感染因素
细菌感染： 最常见的是A组乙型溶血性链球菌，这种细菌会附着在扁桃体隐窝内，大量繁殖，引发炎症反应，导致扁桃体红肿、疼痛等症状。此外，葡萄球菌、肺炎链球菌等细菌也可能引起扁桃体发炎。病毒感染： 多种病毒都能导致扁桃体发炎，比如腺病毒，它可引起滤泡性扁桃体炎；鼻病毒也可能侵袭扁桃体，引发炎症。一般病毒感染引起的扁桃体发炎，病程相对细菌感染可能稍短，但也会让患者出现发热、咽痛等不适。
自身抵抗力因素
免疫力低下时易发病： 当人体自身免疫力下降时，比如过度疲劳、睡眠不足、营养不良等情况，就更容易受到病原体的侵袭，从而引发扁桃体发炎。例如，长期熬夜的人，身体免疫力降低，扁桃体就更易被细菌或病毒感染。儿童免疫力相对较弱： 儿童的免疫系统还在发育阶段，抵抗力相对成人较弱，所以儿童扁桃体发炎的几率比成人更高。比如3 - 10岁的儿童，扁桃体处于活跃期，更容易受到病原体攻击而发炎。
环境因素影响
空气污染刺激： 长期处于空气污染严重的环境中，空气中的有害颗粒、化学物质等会刺激扁桃体，使扁桃体的防御功能受到影响，增加发炎的风险。比如在工业污染严重的地区，居民患扁桃体发炎的概率可能会升高。气候突变影响： 气温突然变化，如寒冷空气刺激，会使扁桃体局部的血液循环发生改变，抵抗力下降，容易引发炎症。像季节更替时，气温波动较大，如果没有及时增减衣物，就容易诱发扁桃体发炎。