维生素B12与甲钴胺在化学结构、作用机制、用途等方面存在区别，具体如下：
一、化学结构：
1.维生素B12属于复合维生素，其结构包含钴离子与一种四环碳的卟啉结构辅基。
2.甲钴胺是维生素B12的一种活性形式，是由维生素B12分子和甲基相结合而形成。
二、作用机制：
1.维生素B12主要参与人体内嘌呤和嘧啶的合成以及脂肪酸代谢等一系列生化过程。
2.甲钴胺作为重要辅酶，参与蛋白质、脂肪和碳水化合物等的代谢过程，同时具有保护神经系统、促进血液生成等作用。
三、用途：
1.维生素B12主要用于对因缺乏维生素B12而引发的贫血、神经系统疾病、消化系统疾病等进行治疗。
2.甲钴胺常应用于贫血、神经系统疾病、肝病、慢性疲劳综合征等疾病的医治。
此外，二者还存在代谢等方面的区别。在使用药物时一定要注意，任何维生素补充剂和治疗都需要在医生的指导下开展，避免过度或不恰当使用而导致不良后果。
总结概况提示：文章详细阐述了维生素B12与甲钴胺在化学结构、作用机制、用途方面的不同之处，还提到了代谢方面的区别，强调用药要遵循医生指导，以避免不良后果。