肱二头肌长头肌腱炎可以通过多种方式处理，一般可以先通过休息等非药物方式缓解，若疼痛明显可考虑药物辅助。
非药物治疗方法
休息与制动： 发病后首先要让肩部充分休息，避免过度使用肩关节，尤其是那些会加重肌腱炎症的动作，比如大幅度的手臂外展、上举等动作。一般建议休息1 - 2周，让肌腱有时间恢复。物理治疗： 可以进行热敷，用温热的毛巾敷在肩部，每次15 - 20分钟，每天3 - 4次，能促进血液循环，缓解疼痛。还可以进行超短波理疗，通过特定的仪器发射超短波，改善局部的炎症状态，减轻疼痛和肿胀。另外，按摩也有一定帮助，但要找专业的按摩师，采用适当的手法放松肩部肌肉，缓解肌腱的紧张。
药物辅助治疗
非甾体抗炎药： 如果疼痛比较明显，可以使用非甾体抗炎药，像布洛芬等。这类药物能抑制体内前列腺素的合成，从而起到抗炎、止痛的作用。不过，这类药物可能会有一些胃肠道不适的副作用，比如恶心、呕吐等，所以要按照医生的指导使用。局部外用药物： 还可以使用局部外用的膏药，比如含有双氯芬酸二乙胺的膏药，直接贴在肩部疼痛的部位，通过皮肤吸收药物，起到抗炎止痛的效果，而且相对口服药物来说，全身副作用会小一些。
康复锻炼
肩部拉伸锻炼： 在疼痛缓解后，可以进行肩部的拉伸锻炼。比如站立位，一只手握住另一只手的肘部，慢慢将手臂向对侧牵拉，每次保持15 - 30秒，然后换另一侧，每天进行3 - 4组。这样可以增加肩关节的活动度，缓解肌腱的紧张。肩部力量锻炼： 可以进行一些简单的肩部力量锻炼，像靠墙俯卧撑。面对墙壁站立，双手撑在墙上，距离与肩同宽，慢慢做俯卧撑的动作，每次做10 - 15个，每天3 - 4组。通过锻炼肩部肌肉，增强对肌腱的稳定作用，预防肌腱炎的复发。但锻炼要循序渐进，避免过度用力导致炎症加重。