一般来说，一觉醒来一只眼睛肿了还疼，可能由以下原因引起：
一、用眼过度：患者若是经常熬夜，或者长时间对着电子产品，导致眼睛无法得到充足休息。此时若再用手大力揉眼睛，就可能引发眼睛肿且疼的状况。
1.长时间用眼：现代人的生活和工作往往离不开电子设备，长时间注视屏幕会使眼睛持续处于紧张状态，得不到放松。
2.熬夜：打乱了正常的作息规律，使得眼睛负担加重。
3.揉眼行为：手部可能带有细菌等，用力揉眼会对眼部造成刺激和损伤。
二、眼部炎症：当患有结膜炎、泪腺炎等眼部炎症时，在炎症的刺激下，细菌过度繁殖和侵袭，可能会出现眼睛肿胀不适并伴有疼痛。
1.结膜炎：可分为多种类型，如细菌性、病毒性等，炎症反应会导致眼部症状。
2.泪腺炎：泪腺发生炎症，影响眼部正常状态。
三、肾炎：若患有肾炎，肾脏的排钠功能会出现异常，进而发生水钠潴留，水液无法正常排泄出去，就会有眼睛浮肿、疼痛等表现。
出现眼部不适症状后，建议患者及时前往医院进行检查，在医生的指导下采取相应的处理措施。总之，眼睛肿疼的原因较多，需要根据具体情况进行准确判断和合理治疗。