脊髓空洞症的治疗需根据病情综合判断，一般手术治疗是重要手段，如对于由枕骨大孔畸形等原因导致的脊髓空洞症，约60% - 70%的患者通过手术能改善症状。
手术治疗方式
后颅窝减压术： 适用于因后颅窝狭窄、小脑扁桃体下疝等导致脊髓空洞的患者。通过扩大后颅窝空间，解除对脊髓的压迫，约能使50% - 60%的患者空洞不再进展甚至缩小。脊髓空洞分流术： 包括空洞 - 蛛网膜下腔分流、空洞 - 腹腔分流等。其中空洞 - 蛛网膜下腔分流术有效率约为40% - 50%，通过将空洞内的液体引流到蛛网膜下腔，减轻脊髓空洞对脊髓的压迫。
药物辅助治疗
神经营养药物： 如维生素B1、维生素B12等，可起到一定的营养神经作用，但单独使用效果有限，一般作为辅助治疗，约能帮助10% - 20%的患者缓解部分神经功能相关的不适。止痛药： 对于伴有疼痛症状的患者，可使用非甾体类抗炎药，如布洛芬等，但需注意长期使用可能有胃肠道等副作用，约30% - 40%的疼痛患者能通过止痛药暂时缓解疼痛。
康复治疗
运动康复： 进行适度的有氧运动，如散步，每天可进行15 - 30分钟，能促进肢体血液循环，增强肌肉力量，约20% - 30%的患者通过规律运动可改善肢体活动能力。物理治疗： 包括按摩、针灸等。针灸对部分患者的肢体感觉、运动功能有一定改善作用，约10% - 20%的患者经针灸后症状有轻微好转，但效果个体差异较大。