阻塞性肺气肿的药物治疗需根据病情来选择，常用的药物包括支气管舒张剂、糖皮质激素等。一般来说，支气管舒张剂能在一定程度上缓解症状，像沙丁胺醇气雾剂等短效支气管舒张剂可快速缓解喘息等症状，而长效支气管舒张剂如沙美特罗替卡松粉吸入剂能较长时间发挥作用。
支气管舒张剂类药物
短效支气管舒张剂： 常用的有沙丁胺醇气雾剂，它能迅速舒张支气管平滑肌，缓解气急等症状，一般在症状发作时按需使用，但不宜长期单一使用。长效支气管舒张剂： 例如沙美特罗替卡松粉吸入剂，它是由长效β₂受体激动剂沙美特罗和糖皮质激素丙酸氟替卡松组成，能起到长效的支气管舒张作用，还可减少气道炎症，通常每天使用一定次数来维持治疗。
糖皮质激素类药物
吸入用糖皮质激素： 像布地奈德气雾剂，可减轻气道炎症反应，长期使用能改善患者的肺功能和症状，降低急性加重的频率。不过使用时要注意正确的吸入方法，保证药物能有效到达气道。口服糖皮质激素： 对于急性加重期症状较重的患者，可能会短期使用泼尼松等口服糖皮质激素，但长期口服会有较多副作用，如骨质疏松、血糖升高等，所以需在医生严密监测下使用。
祛痰药
氨溴索： 它可以降低痰液的黏度，使痰液更容易咳出，适用于有咳痰不易的阻塞性肺气肿患者。一般可以口服，也有静脉制剂，能帮助改善呼吸道通畅情况。乙酰半胱氨酸： 能使痰液中的黏蛋白多肽链断裂，降低痰液黏度，还具有一定的抗氧化作用，可减轻气道炎症，对于痰液黏稠的患者有较好的祛痰效果，有口服剂型和雾化剂型等。
抗菌药物
当阻塞性肺气肿患者出现急性加重，如咳嗽、咳痰增多、痰液颜色改变等怀疑有细菌感染时，会使用抗菌药物。比如阿莫西林克拉维酸钾，适用于敏感菌引起的感染，但要根据病原菌的药敏结果来选择合适的抗菌药物，且使用时要注意疗程，避免滥用导致耐药等问题。