关键点：刚查出怀孕肚子疼，可能是正常早孕反应，也可能是先兆流产或宫外孕。
一、正常早孕反应
怀孕后，一般在停经6周以后，子宫会逐渐增大，牵扯韧带从而出现下腹隐隐胀痛不舒服的情况。这种疼痛通常不明显，且没有阴道分泌物异常和下坠感。在此情况下，通常无需特殊处理，只要注意休息，保持外阴清洁卫生，饮食保持清淡即可。
二、可能是先兆流产或宫外孕
刚明确怀孕不久后出现肚子疼，有可能是先兆流产或者宫外孕。其中一部分会表现出疼痛明显或阵发性腹痛下坠，有的还会伴随阴道少量出血或者出现咖啡色分泌物。此时需要做B超来确定妊娠囊的位置以排除宫外孕，同时结合血HCG和孕酮的指标来评估胚胎的发育情况。
总结概况提示：刚查出怀孕肚子疼有多种可能，要根据具体症状和检查来判断具体原因，并采取相应的措施。