刚查出怀孕肚子疼可能是正常的生理现象，也可能是异常情况引起，需要具体分析。
1.正常的生理现象：怀孕后，子宫逐渐增大，可能会牵拉子宫周围的韧带，引起轻微的肚子疼。此外，怀孕后体内激素水平变化，也可能导致胃肠道不适，出现肚子疼。这些情况通常不需要特殊处理，注意休息，避免劳累和剧烈运动，饮食清淡，多可缓解。
2.异常情况：
先兆流产：怀孕后出现肚子疼，伴有阴道流血，可能是先兆流产的表现。需要及时就医，进行超声检查和孕酮、人绒毛膜促性腺激素（hCG）等检查。如果确诊为先兆流产，需要卧床休息，使用黄体酮等保胎药物治疗。
宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床称为宫外孕，以输卵管妊娠最常见。宫外孕时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂，引起腹腔内出血，出现剧烈的肚子疼。宫外孕是一种非常危险的情况，需要及时就医，进行超声检查和血β-hCG等检查，明确诊断后，采取手术或药物治疗。
其他：怀孕后合并阑尾炎、卵巢囊肿蒂扭转等疾病，也可能出现肚子疼。
需要注意的是，刚查出怀孕肚子疼时，应及时就医，进行详细的检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉悦。如果肚子疼逐渐加重或伴有其他异常症状，应立即就医。此外，在怀孕早期，还应注意补充叶酸，预防神经管畸形。