刚查出来怀孕肚子疼，可能是以下原因引起：
1.正常生理现象：怀孕后，子宫逐渐增大，可能会牵拉周围的组织和韧带，引起轻微的肚子疼。此外，怀孕后体内激素水平变化，也可能会导致盆腔充血，出现下腹坠胀感。这些都是正常的生理现象，一般不需要特殊处理，注意休息，避免劳累和剧烈运动，症状会逐渐缓解。
2.先兆流产：如果肚子疼同时伴有阴道流血，可能是先兆流产的表现。需要及时就医，进行超声检查和孕酮、人绒毛膜促性腺激素（hCG）等检查。如果确诊为先兆流产，需要卧床休息，必要时进行保胎治疗。
3.宫外孕：宫外孕是指受精卵在子宫以外的部位着床发育，常见的部位是输卵管。宫外孕可能会导致肚子疼，严重时还会引起大出血，危及生命。如果怀孕后出现肚子疼，尤其是一侧下腹部疼痛，伴有阴道流血，需要及时就医，进行超声检查和血β-hCG等检查，以排除宫外孕的可能。
4.其他：怀孕后合并其他疾病，如阑尾炎、胃炎、胃溃疡等，也可能会引起肚子疼。
需要注意的是，每个人的情况都可能不同，如果肚子疼持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医，以便明确原因并采取相应的治疗措施。此外，怀孕后要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持良好的心情，合理饮食，按时产检。