大便肛门痛的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。肛裂引起的疼痛，呈周期性，多在大便时或大便后加重，排便后数分钟疼痛可缓解。
2.外痔：肛门缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，疼痛明显。
3.内痔或混合痔：内痔或混合痔发展到一定程度即能脱出肛门外，内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，也会导致剧烈疼痛。
4.肛管及周围炎症：肛窦炎、肛乳头炎、肛周脓肿、肛瘘等均可引起肛门疼痛。
5.肛门损伤：如肛裂、侧切等手术后，伤口感染，或肛管直肠周围脓肿切开引流后，均可导致疼痛。
6.肛门直肠神经官能症：阴部神经症候群、直肠炎症等均可引起肛门疼痛。
7.其他：如直肠、肛管恶性肿瘤，较大的内痔或混合痔，肛乳头肥大、肛管直肠癌等，也会导致肛门疼痛。
总之，引起大便肛门痛的原因很多，患者应及时到医院就诊，明确病因，以便进行针对性治疗。