初期子宫内膜异位症的症状表现多样，其中最常见的是盆腔疼痛，约有15% - 30%的患者会出现慢性盆腔痛，这种疼痛可能在月经期间加重，持续时间较长。
盆腔疼痛表现
经期疼痛： 多数患者会出现继发性痛经，且疼痛多从月经前1 - 2天开始，月经第1天最严重，以后逐渐减轻，可伴有下腹部、腰骶部及盆腔中部疼痛，疼痛程度个体差异较大，有的患者疼痛剧烈，影响日常生活和工作。非经期疼痛： 除了经期疼痛，部分患者在非月经期间也会有盆腔区域的隐痛或胀痛，尤其是在性交、排便等情况时可能会加重。
月经异常表现
经量增多： 约15% - 30%的患者会出现经量增多的情况，表现为月经周期基本正常，但经量较以往明显增多，有的患者月经量可超过80ml。经期延长： 部分患者经期会延长，月经持续时间较正常情况延长，可能超过7天。
生育相关表现
受孕困难： 子宫内膜异位症会对生育产生一定影响，大约30% - 50%的子宫内膜异位症患者会出现不孕的情况。这是因为异位的内膜会影响盆腔内的环境，如干扰输卵管的蠕动、影响卵巢的排卵功能等，从而阻碍受孕。异位妊娠风险增加： 子宫内膜异位症患者发生异位妊娠（宫外孕）的风险比正常女性要高，大约是正常女性的2 - 3倍。这是由于异位内膜的存在可能会影响受精卵的正常运输，使其在子宫以外的部位着床。