慢性疲劳综合征是一种持续或反复发作的疲劳状态，患者通常会感到极度疲倦，这种疲劳休息后也无法缓解，且持续时间一般超过6个月。
身体方面的临床表现
肌肉症状： 患者常出现全身肌肉疼痛，比如肩颈、腰背等部位，有的还会有肌肉无力感，拿东西、爬楼梯等简单活动都可能变得吃力。骨骼症状： 部分患者有关节疼痛，多为非特异性的关节痛，可累及多个关节，像膝关节、踝关节等，疼痛程度不一，有的较轻，有的会影响日常活动。
神经系统方面的临床表现
睡眠障碍： 很多慢性疲劳综合征患者存在睡眠问题，表现为入睡困难、睡眠浅易惊醒，即便睡了很久，醒来后仍感觉没休息好，白天精神更加萎靡。认知功能异常： 会出现注意力不集中、记忆力下降的情况，患者可能很难集中精力工作或学习，记东西也比以往费劲，比如经常忘记刚说过的话、做过的事。
消化系统方面的临床表现
食欲改变： 有的患者食欲减退，不想吃东西，导致体重可能会下降；而有的患者可能会出现食欲亢进，但即便吃很多，身体也没有得到很好的能量补充。胃肠不适： 常见的有腹胀、腹痛、腹泻或便秘等症状，胃肠功能紊乱较为常见，这些症状会进一步影响患者的营养吸收和身体状态。
其他方面的临床表现
精神情绪问题： 患者容易出现抑郁、焦虑等情绪问题，情绪波动较大，可能突然感到心情低落、烦躁不安，长期的疲劳和身体不适会加重心理负担，形成恶性循环。免疫功能异常： 部分患者会感觉容易生病，免疫力相对较低，比常人更易受到病毒、细菌等病原体的侵袭，经常感冒、呼吸道感染等。