上呼吸道感染70%~80%由病毒引起，如鼻病毒、冠状病毒等，细菌感染占20%~30%，像A组β溶血性链球菌等。
病毒因素：
常见病毒类型：鼻病毒是引发普通感冒最常见的病毒之一，它有100多种血清型，容易在人群中传播，尤其在秋冬季节高发。冠状病毒也是常见的导致上呼吸道感染的病毒，比如引起普通感冒的229E、OC43型冠状病毒，还有引发重症的中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）和严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）。传播方式：病毒主要通过飞沫传播，当感染者打喷嚏、咳嗽或说话时，产生含有病毒的飞沫，其他人吸入这些飞沫就可能被感染；也可以通过接触传播，接触被病毒污染的物品后，再触摸自己的眼、鼻、口等部位，从而引发感染。
细菌因素：
常见致病细菌：A组β溶血性链球菌是导致上呼吸道细菌感染的常见致病菌之一，它可引起急性扁桃体炎，患者会出现咽痛、扁桃体红肿等症状。肺炎链球菌也可能引发上呼吸道感染相关疾病，如肺炎链球菌性咽炎等。感染途径：细菌感染多是在人体免疫力下降时，原本寄居于上呼吸道的细菌大量繁殖致病，或者外界的细菌侵入人体上呼吸道引发感染。比如在气候突变、过度劳累等情况下，人体抵抗力降低，细菌就容易趁机而入。
环境与个体因素：
环境因素影响：长期处于空气污染严重的环境中，比如空气中PM2.5浓度过高，会刺激上呼吸道黏膜，降低呼吸道的防御功能，增加上呼吸道感染的风险。另外，寒冷的环境也容易诱发上呼吸道感染，寒冷会使上呼吸道血管收缩，局部血液循环不畅，免疫细胞的功能受到影响，从而更容易让病毒或细菌侵入。个体因素影响：儿童由于免疫系统尚未发育完善，相比成年人更容易患上呼吸道感染，5岁以下儿童发病率较高。老年人随着年龄增长，身体的免疫功能逐渐衰退，也是上呼吸道感染的高发人群。还有本身患有慢性疾病，如糖尿病、心脏病等的人群，他们的身体抵抗力相对较弱，也容易发生上呼吸道感染。