长时间舌头溃疡可能由多种原因引起。一般来说，免疫力低下是常见因素之一，比如当人体免疫力处于较低水平时，就更容易受到病菌等的侵袭，从而引发舌头溃疡，有研究显示，约30% - 40%的舌头溃疡与免疫力下降有关。
局部刺激因素
分点1：牙齿残根残冠：如果口腔内有锐利的牙齿残根或者残冠，它们会不断摩擦舌头，长时间的摩擦就容易导致舌头溃疡。例如，有患者因为长期不处理坏掉的牙齿，残根不断刺激舌头，经过数月甚至更久，就出现了长时间不愈的舌头溃疡。分点2：不良咬合习惯：有些人有咬舌、磨牙等不良咬合习惯，这也会反复刺激舌头黏膜，进而引发长时间的舌头溃疡。比如有的患者经常不自觉地咬舌头，久而久之，舌头部位就会经常出现溃疡且难以愈合。
营养缺乏
分点1：维生素缺乏：当人体缺乏维生素B族时，就容易出现舌头溃疡长时间不愈的情况。尤其是维生素B2（核黄素）缺乏，会影响口腔黏膜的正常代谢，使得舌头黏膜的修复能力下降，从而导致溃疡长时间存在。一般来说，正常成年人每天需要摄入一定量的维生素B族来维持身体正常运转，缺乏时就易引发问题。分点2：微量元素缺乏：锌等微量元素的缺乏也可能导致舌头溃疡长时间不好。锌参与人体多种酶的合成和代谢，对维持黏膜的完整性很重要。如果体内锌含量不足，就会影响舌头黏膜的修复，使得溃疡难以愈合。
全身性疾病影响
分点1：消化系统疾病：像胃溃疡、十二指肠溃疡等消化系统疾病，可能会影响营养物质的吸收，进而导致身体抵抗力下降，容易引发舌头溃疡且长时间不愈。例如，有胃溃疡患者就经常伴随舌头溃疡长时间不愈合的情况，因为消化系统疾病会影响营养吸收，使得身体缺乏修复黏膜所需的营养成分。分点2：免疫系统疾病：一些免疫系统疾病，如白塞病，会反复出现口腔黏膜溃疡，其中就包括舌头溃疡，而且往往持续时间较长。白塞病是一种慢性自身免疫性疾病，会累及多个系统，口腔黏膜溃疡是其常见的症状之一，且容易反复发作、长时间不愈。