舌头长口腔溃疡的原因有多种。一般来说，大约20% - 30%的口腔溃疡与遗传因素有关，如果家族中有口腔溃疡反复发作的情况，那么个体患病风险会增加。
局部创伤因素
口腔咬伤： 比如在进食时不小心咬到舌头，就容易形成口腔溃疡，这种情况在吃饭速度快、注意力不集中的人群中较为常见。牙刷刺伤： 使用过硬的牙刷或者刷牙方法不当，用力过猛，可能会刺伤舌头，从而引发口腔溃疡，一般这种情况导致的溃疡面积通常不大。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 当体内缺乏维生素B族时，尤其是维生素B2、B6等，容易出现舌头长口腔溃疡的情况。例如，长期挑食、节食的人，很可能会因为维生素摄入不足而引发溃疡，一般这种缺乏情况持续较长时间后才会出现明显症状。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素的缺乏也与舌头口腔溃疡有关。锌参与人体多种酶的合成，缺乏锌会影响伤口愈合，从而容易导致口腔溃疡的发生；铁是血红蛋白的组成成分，缺乏铁会影响身体的正常代谢，增加口腔溃疡的发病几率。
免疫系统因素
免疫力下降： 当人体免疫力下降时，比如过度疲劳、感冒发烧等情况下，身体的免疫防御功能减弱，就容易让潜在的导致口腔溃疡的因素活跃起来，引发舌头口腔溃疡。一般在免疫力下降后的1 - 2周内可能会出现溃疡症状。自身免疫性疾病： 某些自身免疫性疾病也可能导致舌头长口腔溃疡，例如白塞病，除了舌头溃疡外，还可能伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状，这种疾病相对较为少见，但需要引起重视。