肛门疼痛且有过出血症状，可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、出血。常因便秘导致肛管皮肤裂伤，好发于肛管后正中部位。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，可发生水肿、感染、坏死，导致肛门疼痛、出血。
3.肛管或直肠损伤：肛管或直肠因外伤或手术致裂伤，可引起肛门疼痛、出血。
4.肛门直肠周围脓肿：常见的是肛提肌下脓肿，多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。脓肿形成时，患者感肛门疼痛、坠胀，有明显的全身症状，如发热、乏力等。
5.肛管直肠恶性肿瘤：肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，引起局部疼痛，伴有出血。
6.其他：肛门部手术、外伤后，因肛门狭窄、感染，可导致肛门疼痛、出血。此外，直肠炎、肛乳头炎等也可引起肛门疼痛、出血。
如果出现肛门疼痛且有过出血症状，建议及时就医，明确诊断。治疗方法包括药物治疗、坐浴、手术治疗等，具体治疗方法应根据病因和病情而定。同时，患者应注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，预防便秘。