隐睾是指睾丸未能按照正常发育过程从腰部腹膜后下降至阴囊内。其引起的原因主要有以下几方面。首先是内分泌因素，胎儿生长过程中，垂体分泌的促性腺激素不足，会影响睾丸下降，大约有30%的隐睾患儿存在内分泌因素，比如促黄体生成素-促卵泡激素缺乏等情况。
解剖因素
机械性梗阻：比如精索血管或输精管太短，会阻碍睾丸下降。另外，睾丸引带发育异常或缺如，不能将睾丸正常牵引至阴囊，也是导致隐睾的解剖因素之一。据统计，约有5% - 7%的隐睾患儿存在解剖结构异常相关问题。
遗传因素
有研究表明，隐睾具有一定的遗传倾向。如果家族中有隐睾病史，那么后代发生隐睾的风险会增加。目前发现了一些与隐睾相关的基因变异，这些基因变异可能影响睾丸的正常发育和下降过程。
环境因素
母亲在孕期接触某些有害物质，如农药、化学毒物等，可能会影响胎儿睾丸的发育和下降。另外，孕期母亲吸烟、饮酒等不良生活习惯，也可能增加胎儿出现隐睾的概率。有调查显示，孕期母亲有不良生活习惯的情况下，胎儿隐睾发生率比正常情况高出约20%左右。