子宫内膜异位症的发生可能与多种因素有关。目前认为，子宫内膜种植学说、免疫调节异常、遗传因素等都可能参与其中。其中，子宫内膜种植学说较为被认可，经血逆流时，子宫内膜碎片可随经血通过输卵管进入盆腔，种植在卵巢、盆腔腹膜等部位，从而引发子宫内膜异位症，据统计，约10% - 15%的育龄女性患有子宫内膜异位症。
经血逆流相关因素
经期剧烈运动：女性在经期如果进行剧烈运动，比如快跑、跳绳等，会增加经血逆流的几率。因为剧烈运动可能会使宫腔压力增大，促使子宫内膜碎片更容易通过输卵管逆流到盆腔。经期性生活：经期性生活也可能导致经血逆流。性生活时的子宫收缩等动作，会影响经血的正常排出途径，增加子宫内膜碎片逆流到盆腔的风险。
免疫调节异常方面
自身免疫功能缺陷：人体的免疫系统如果存在缺陷，就不能正常清除逆流到盆腔的子宫内膜碎片。正常情况下，免疫系统可以识别并清除这些异位的内膜组织，但当免疫功能出现问题时，就无法完成这个清除过程，进而导致子宫内膜异位症的发生。炎症反应影响：盆腔内的炎症反应也会影响免疫调节。长期的盆腔炎症会改变盆腔内的微环境，使得子宫内膜碎片更容易在盆腔内种植生长，因为炎症环境可能有利于内膜组织的存活和增殖。
遗传因素相关
家族遗传倾向：如果家族中有亲属患有子宫内膜异位症，那么女性患病的风险会增加。研究发现，子宫内膜异位症具有一定的遗传易感性，可能与某些基因的突变或遗传多态性有关。例如，某些与细胞黏附、免疫调节相关的基因发生突变时，就可能增加患子宫内膜异位症的几率。基因携带与发病：携带特定基因的女性，相对更容易患上子宫内膜异位症。虽然具体的相关基因还在不断研究中，但已经发现遗传因素在其中起到了一定的作用，大约15% - 20%的子宫内膜异位症患者有家族史。