子宫内膜异位症的发生是多种因素共同作用的结果。目前认为，经血逆流种植是主要原因之一，据统计，约10% - 15%的育龄女性有经血逆流的情况，但其中只有少数人会发展为子宫内膜异位症。
经血逆流种植
经期宫腔压力变化： 在月经期间，子宫腔和输卵管之间存在压力差，子宫内膜碎片可能会随着经血通过输卵管逆流进入盆腔。正常情况下，这些逆流的内膜碎片会被人体的免疫系统清除，但如果免疫系统出现异常，就无法及时将其清除，内膜碎片就会在盆腔等部位种植生长，从而引发子宫内膜异位症。输卵管蠕动异常： 输卵管的正常蠕动有助于将宫腔内的物质向体外排出。如果输卵管蠕动功能出现异常，比如蠕动过慢或过快，就会影响内膜碎片的正常排出，增加内膜碎片在盆腔种植的机会。
体腔上皮化生
腹膜的化生： 腹膜是人体体腔的一部分，原始体腔上皮具有潜在的分化能力，在某些因素的刺激下，比如炎症等，腹膜的体腔上皮可能会化生为子宫内膜样组织。当这些化生的组织种植在盆腔等部位时，就可能发展为子宫内膜异位症。例如，长期的盆腔炎症刺激可能会促进腹膜的体腔上皮化生过程。卵巢表面上皮的化生： 卵巢表面的上皮也属于体腔上皮的一种，同样可能在各种因素影响下发生化生，进而形成异位的子宫内膜组织，导致子宫内膜异位症的发生。
免疫调节异常
免疫系统识别缺陷： 人体的免疫系统能够识别并清除外来的异物和异常细胞。但在子宫内膜异位症患者中，免疫系统可能存在识别缺陷，无法有效识别和清除逆流到盆腔的子宫内膜碎片。例如，患者体内的自然杀伤细胞活性可能降低，使得内膜碎片能够在盆腔内存活并种植。细胞因子失衡： 体内的细胞因子在免疫调节和组织修复等过程中发挥着重要作用。子宫内膜异位症患者体内的细胞因子可能存在失衡情况，比如一些促炎症因子水平升高，会促进异位内膜的生长和炎症反应，进一步加重子宫内膜异位症的病情。例如，白细胞介素 - 1、白细胞介素 - 6等促炎症因子的异常升高可能与子宫内膜异位症的发生发展密切相关。