尿道炎主要是由病原体感染引起的，其中最常见的是大肠埃希菌，约占60%~80%。此外，还有淋球菌、沙眼衣原体、解脲支原体等病原体也可引发尿道炎。
病原体感染途径
性传播感染： 通过无保护的性行为传播，比如淋球菌感染主要通过性接触传播，在不洁性行为后，淋球菌容易侵犯尿道黏膜，引发尿道炎。沙眼衣原体、解脲支原体等也常通过性接触导致尿道感染。间接接触感染： 接触被病原体污染的物品也可能感染尿道炎，比如使用公共浴池、浴巾、马桶等，若这些物品被带有病原体的分泌物污染，健康人接触后就有可能被感染，但这种情况相对性传播来说概率较低。
自身因素影响
局部卫生不良： 女性尿道短而宽，若不注意外阴部清洁，细菌容易滋生并侵入尿道引发感染。比如有些女性不经常更换内裤，或者不注意经期卫生等，都可能增加尿道炎的发病风险。男性如果包皮过长，包皮内易藏污纳垢，也容易导致尿道受感染。机体免疫力下降： 当人体免疫力低下时，比如患有糖尿病、长期使用免疫抑制剂等情况，身体对病原体的抵御能力减弱，容易受到病原体侵袭而引发尿道炎。例如糖尿病患者血糖控制不佳时，机体的抗感染能力下降，更易发生尿道感染。
医源性因素
尿道器械检查： 进行尿道插管、膀胱镜检查等操作时，如果消毒不严格，可能将外界的病原体带入尿道，引起医源性尿道炎。比如在进行导尿操作时，若没有严格遵循无菌操作流程，就有可能导致尿道感染。一般来说，这类操作后1~2周内是尿道炎的高发时间段。