尿道炎通常是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌等，大约50%的尿道炎是由大肠杆菌导致的。
病原体感染因素
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，它常存在于肠道内，当机体抵抗力下降或尿道黏膜有损伤时，就容易侵入尿道引发感染。比如女性尿道短而宽，距离肛门较近，大肠杆菌更容易侵入尿道，所以女性尿道炎的发病率相对较高。支原体、衣原体感染： 支原体和衣原体也可引起尿道炎，主要通过性接触传播。在性活跃的人群中，感染的风险会增加。例如，有多个性伴侣的人，感染支原体、衣原体导致尿道炎的几率比单一性伴侣者要高很多。
尿道局部因素
尿道梗阻： 如尿道结石、狭窄等情况会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内停留时间过长，为细菌滋生提供了有利条件，容易引发尿道炎。比如尿道结石患者，结石阻塞尿道，尿液引流受阻，细菌就容易在局部繁殖，从而引发炎症。尿道损伤： 尿道器械检查、性生活等都可能导致尿道黏膜损伤，使细菌容易侵入造成感染。例如，进行导尿操作时，如果消毒不严格，就可能损伤尿道黏膜并引入细菌，引发尿道炎。
机体免疫因素
抵抗力下降： 当人体免疫力较低时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病（如糖尿病等）时，身体对病原体的抵御能力减弱，容易发生尿道炎。像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体的免疫功能受到影响，更容易受到细菌等病原体的侵袭而引发尿道感染。局部卫生不良： 不注意外阴部的清洁卫生，会使细菌容易滋生，增加尿道炎的发病风险。尤其是女性，如果不经常清洗外阴，不勤换内裤，细菌就容易在尿道口繁殖，进而侵入尿道引起炎症。