舌根疼且咽口水都疼，通常可能是以下原因导致。
一、上火：当天气较为干燥或过量食用辛辣刺激性食物，例如火锅、麻辣烫、辣椒、生姜、大蒜等，就可能引发上火，进而出现舌根疼且咽口水都疼的状况。对此，患者可遵医嘱使用相关药物进行治疗，比如黄连上清片具有散风清热、泻火止痛的功效，可用于治疗风热上攻、肺胃热盛所致的头晕目眩、暴发火眼、牙齿疼痛、口舌生疮、咽喉肿痛等；牛黄解毒片能清热解毒，用于火热内盛、咽喉肿痛、牙龈肿痛、口舌生疮等；牛黄清胃丸有清胃泻火、润燥通便的作用，适用于心胃火盛、头晕目眩、口舌生疮等。
二、口腔溃疡：口腔溃疡是指各种因素致使舌、颊、唇、牙龈、软腭等口腔黏膜上形成小而浅的缺损或溃烂，具体表现为局部溃烂、剧烈疼痛、有灼烧感等，所以舌根疼且咽口水都疼可能是口腔溃疡所致。患者可遵医嘱采用药物治疗，如口腔溃疡散可清热敛疮，用于口腔溃疡；复方苯佐卡因凝胶能缓解疼痛，适用于复发性口腔溃疡的短期治疗；珍珠冰硼散有去腐、解毒、消炎止痛的功效，可用于口舌生疮等。
三、慢性咽炎：慢性咽炎是指咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织的弥漫性慢性炎症，具体表现为咽痛、咽干、吞咽困难、嗓子疼痛、有异物感等，因此舌根疼且咽口水都疼可能是慢性咽炎导致。患者可遵医嘱运用药物来治疗，比如薄荷喉片具有清凉、止痛、防腐的作用，用于咽喉炎、扁桃体炎及口臭等；复方氯己定含漱液用于牙龈炎、冠周炎、口腔黏膜炎等引致的牙龈出血、牙周脓肿、口腔黏膜溃疡等的辅助治疗；清咽滴丸有疏风清热、解毒利咽的功效，可用于风热喉痹、咽痛、咽干、口渴等。
总结提示：舌根疼咽口水疼可能由上火、口腔溃疡、慢性咽炎等引起，可根据具体病因选择合适药物治疗。