一年内连着吃两次紧急避孕药危害相对较大，可能会导致月经紊乱，有研究显示，约10% - 20%的女性在一年内多次使用紧急避孕药后会出现月经周期改变，比如月经提前或推迟7天以上。
对月经的影响
月经紊乱表现： 紧急避孕药会影响体内激素水平，连续两次服用可能使月经周期变得不规律，出现月经量增多或减少的情况。有的女性服药后月经量可能较以往明显增多，持续时间也可能延长；而有的则会出现月经量大幅减少，甚至出现短暂闭经的现象。持续时间： 这种月经紊乱的情况一般可能会持续1 - 3个月经周期才能逐渐恢复，但也有部分女性需要更长时间来调整体内激素水平以恢复正常月经。
对内分泌的干扰
激素失衡风险： 紧急避孕药主要成分是孕激素，连续服用两次会加重内分泌系统的紊乱。长期的激素失衡可能会影响卵巢的正常功能，导致卵巢排卵异常等问题。例如，可能会使原本规律的排卵变得不规律，影响受孕几率。其他内分泌相关影响： 还可能引起乳房胀痛等情况，这也是因为激素水平波动导致的，一般在停药后会有所缓解，但连续两次服用会让这种激素波动更为明显，乳房胀痛的程度和持续时间可能相对更长。
对身体其他方面的潜在影响
肠胃不适几率增加： 连续服用两次紧急避孕药，肠胃不适的发生率会升高。常见的有恶心、呕吐等症状，有的女性服药后恶心症状较为明显，甚至可能影响进食，这种肠胃不适一般在服药后数小时内出现，可能会持续1 - 2天，但连续多次服用会让肠胃受到的刺激更频繁。避孕失败风险： 虽然紧急避孕药的避孕机制是通过干扰排卵和受精过程来达到避孕目的，但连续两次服用并不能保证绝对避孕成功，反而可能因为激素水平的紊乱影响避孕效果，增加避孕失败从而意外怀孕的风险，一旦意外怀孕进行人工流产等操作对身体的伤害会更大。