骨髓炎主要是由细菌感染引起的，其中金黄色葡萄球菌是最常见的致病菌，约占所有骨髓炎致病菌的50%~70%。
创伤性因素导致
开放性骨折引发：当骨骼受到开放性创伤，比如骨折后伤口直接与外界相通，细菌就容易侵入骨骼引发骨髓炎。例如，车祸导致的开放性胫骨骨折，伤口污染严重时，感染细菌的几率就会大大增加。术后感染引起：一些骨科手术，像人工关节置换术等，术后如果护理不当，也可能发生感染进而导致骨髓炎。有研究显示，这类术后骨髓炎的发生率大约在1%~5%左右。
血源性感染导致
儿童易发病：儿童时期，由于骨骺板附近的微小终末动脉与毛细血管往往更为弯曲，容易形成血管襻，血液流经此处时，细菌就容易停滞，所以儿童血源性骨髓炎相对多见。比如5~15岁的儿童就比较容易因血源性感染患上骨髓炎。免疫力低下时：当人体免疫力低下时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人群，身体抵抗细菌的能力下降，细菌就可能通过血液循环到达骨骼，引发骨髓炎。
邻近感染蔓延导致
软组织感染波及：如果邻近骨骼的软组织发生感染，如足部的甲沟炎、足底溃疡等，感染可能会蔓延至骨骼，从而引发骨髓炎。像糖尿病患者足部容易出现溃疡，进而引发足部骨骼的骨髓炎。关节感染累及：关节部位的感染，例如化脓性关节炎，如果没有得到及时有效的治疗，感染也可能向周围骨骼蔓延，导致骨髓炎。比如化脓性髋关节炎可能会累及髋关节周围的骨骼引发骨髓炎。