肠炎的治疗药物需根据病因等情况选择，一般来说，对于感染性肠炎，常用抗生素等药物。比如细菌感染引起的肠炎，可使用喹诺酮类等抗生素，但18岁以下人群通常不建议使用喹诺酮类药物。而对于非感染性肠炎，如炎症性肠病等，可能会用到氨基水杨酸制剂、糖皮质激素等药物。
一、感染性肠炎常用药物
细菌感染相关药物：如果是细菌感染导致的肠炎，常用的有黄连素，它对多种细菌有抑制作用，能缓解肠炎引起的腹泻等症状。另外，对于一些严重的细菌感染肠炎，可能会用到头孢类抗生素，不过使用头孢类抗生素前需要确认患者没有头孢过敏史。病毒感染相关药物：病毒感染引起的肠炎一般是自限性的，通常不需要特殊的抗病毒药物治疗，但如果腹泻严重，可使用蒙脱石散来止泻，蒙脱石散能吸附肠道内的病毒和毒素，起到保护肠道黏膜的作用，一般成人每次服用1袋（3克），每天3次。
二、非感染性肠炎常用药物
炎症性肠病相关药物：对于溃疡性结肠炎等炎症性肠病，氨基水杨酸制剂是常用药物，如柳氮磺吡啶，它可以抑制肠道的炎症反应。而糖皮质激素如泼尼松，在病情较重时可使用，能快速减轻炎症，但长期使用可能会有较多副作用，需要在医生密切监测下使用。肠易激综合征相关药物：如果是肠易激综合征导致的肠炎样症状，对于腹泻型的可能会用到洛哌丁胺，它能抑制肠道蠕动，减少腹泻次数，但要注意不能长期大量使用。对于伴有腹痛的患者，可能会用到匹维溴铵，它能调节肠道平滑肌的运动，缓解腹痛症状。
三、其他辅助药物
益生菌类药物：肠炎患者常常会伴有肠道菌群失调，这时候可以补充益生菌，比如双歧杆菌四联活菌片，它能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，有助于肠炎的恢复，一般成人一次2 - 3片，一天3次。补液药物：肠炎患者如果腹泻、呕吐较严重，容易出现脱水和电解质紊乱，这时候需要补充电解质溶液，像口服补液盐Ⅲ，它可以补充水分和钠、钾等电解质，预防和纠正脱水，成人可以根据腹泻量按说明书服用。