川崎病的具体病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。目前认为川崎病可能是由多种病原体感染触发了机体的异常免疫反应所导致。
感染因素相关
病毒感染： 多种病毒可能与川崎病的发生有关，比如逆转录病毒、疱疹病毒等。有研究发现部分川崎病患儿发病前有病毒感染的迹象，但具体的病毒如何引发川崎病还在进一步探索中。细菌感染： 链球菌等细菌感染也被怀疑与川崎病有一定关联，不过相关机制还不十分清楚，只是发现川崎病患儿发病时可能存在细菌感染相关的免疫异常表现。
免疫因素相关
异常免疫激活： 患儿体内的免疫系统会出现过度激活的情况。正常情况下免疫系统是针对外来病原体进行防御，而在川崎病患儿体内，免疫系统被错误激活，产生大量的细胞因子和炎症介质，这些物质会导致血管的炎症反应。比如会释放白细胞介素 - 1、白细胞介素 - 6等多种细胞因子，引起全身小血管炎，累及冠状动脉等重要血管。遗传易感性： 有研究表明川崎病具有一定的遗传易感性。某些特定的基因位点可能会增加患川崎病的风险。比如一些与免疫调节相关的基因，如果存在某些突变或变异，就可能使个体更容易在感染等因素刺激下发生川崎病相关的免疫异常反应。
其他可能因素
环境因素： 居住环境中的某些因素也可能对川崎病的发生有影响。比如长期暴露在某些化学物质、污染环境中，可能会影响机体的免疫功能，从而增加患川崎病的几率，但具体的作用机制还需要更多的研究来证实。个体差异： 不同个体之间的生理和病理差异也可能与川崎病的发生有关。比如年龄较小的儿童相对更容易患川崎病，尤其是5岁以下的婴幼儿发病率相对较高，这可能与他们的免疫系统发育尚未完善等个体因素有关。