怀孕三个多月头疼，其原因较多，可能是受凉、情绪因素、低血糖、缺钙等所致。建议先就医检查明确原因，再在医生指导下进行相应治疗。具体如下：
一、受凉：怀孕后体内血液循环和新陈代谢加快，部分孕妇可能体温升高且怕冷，若不注意保暖而受冷风刺激，易引发头部不适。平时应多注意保暖，养成良好作息习惯，这有助于症状改善。
二、情绪因素：体内雌孕激素水平升高可能影响内分泌系统，导致植物神经功能紊乱，出现头晕、视物模糊、胸闷、胃痛等表现。平时要多注意休息，保持良好心态并转移注意力，可帮助改善症状。
三、低血糖：因糖摄入、生成不足或消耗过多，使血浆葡萄糖水平下降，患者可有心悸、大汗、饥饿等症状。应及时补充含糖食物以改善症状，症状严重者需及时就诊，通过静脉注射葡萄糖注射液治疗。
四、缺钙：随着妊娠时间推移，体内雌激素水平不稳定，且胎儿新陈代谢快需大量钙质，若体内钙量不足，可能导致大脑皮层兴奋，影响睡眠，出现头晕、头痛、失眠等症状。平时应多吃含钙丰富食物，必要时可在医生指导下使用维D钙咀嚼片、碳酸钙D3片、葡萄糖酸钙片等进行治疗。
此外，妊娠期高血压等也可能导致该症状。症状严重者应及时就诊，以免延误病情。