肺栓塞的治疗需根据具体情况选择合适方法，一般来说，抗凝治疗是重要的基础治疗手段，如普通肝素，通常在住院期间开始使用，通过抑制凝血过程来阻止血栓进一步发展，初始剂量一般为80U/kg静脉推注，之后以18U/(kg·h)持续静脉滴注。
抗凝治疗药物选择
普通肝素： 通过与抗凝血酶Ⅲ结合，增强其抗凝作用，起效较快，但需要密切监测凝血功能，根据结果调整剂量。低分子肝素： 生物利用度较高，抗凝效果相对稳定，一般不需要频繁监测凝血指标，可皮下注射，如达肝素钠等。
溶栓治疗情况
适用人群： 对于大面积肺栓塞（有明显呼吸困难、胸痛、低氧血症等）且无禁忌证的患者，可考虑溶栓治疗。一般发病14天内使用溶栓药物较有效。常用溶栓药： 尿激酶，可直接激活纤溶酶原变为纤溶酶，溶解血栓，但有出血风险，使用前需评估患者出血倾向等情况。
手术治疗方式
肺动脉血栓摘除术： 适用于病情非常严重、危及生命且经积极内科治疗无效的患者。这种手术风险较高，需要在具备相应条件的大型医院，由经验丰富的外科医生操作。导管碎解和抽吸血栓： 对于一些急性大面积肺栓塞患者，可通过导管将血栓破碎并抽吸出来，改善肺循环，但也有一定的适应证和操作要求。
抗凝治疗后的长期管理
口服抗凝药： 经过初始的抗凝治疗后，可能需要长期口服抗凝药，如华法林，需要定期监测国际标准化比值（INR），将INR控制在2~3之间以达到较好的抗凝效果，同时要注意药物相互作用等问题。还有新型口服抗凝药，如利伐沙班等，不需要频繁监测INR，但价格相对较高，使用时也需遵循相应的用药注意事项。