胃功能紊乱症状表现多样，常见的有消化不良，约有30% - 50%的胃功能紊乱患者会出现餐后饱胀感，感觉食物长时间停留在胃里不消化。
胃肠道不适表现
腹痛： 多数患者会有腹痛症状，疼痛部位不固定，一般为隐痛或胀痛，疼痛程度轻重不一，有的患者疼痛会在进食后加重，但也有的在进食后缓解。腹胀： 大约有40% - 60%的胃功能紊乱患者会出现腹胀情况，尤其是在进食较多食物后，腹胀感更为明显，可持续数小时甚至一整天。
伴随全身症状
神经精神症状： 部分患者会伴有神经精神方面的症状，比如约20% - 30%的患者会出现焦虑、抑郁的情绪，还可能有失眠、头晕等表现。患者可能会因为胃部不适而影响睡眠，进而导致白天精神不佳、头晕等。其他症状： 少数患者还可能出现乏力、心悸等症状，但相对比较少见。
与饮食相关的特点
进食相关症状： 胃功能紊乱与饮食关系密切，有的患者会在进食少量食物后就出现饱胀感，也就是所谓的早饱；还有些患者会对特定食物敏感，比如吃了辛辣、油腻食物后胃部不适加重，大约有10% - 20%的患者会有这种对特定食物的敏感情况。症状波动： 症状会有波动，有时症状较轻，患者能正常生活，但有时可能会突然加重，影响日常生活和工作。比如原本能正常上班，可能某一天因为饮食不当或者压力大，胃部不适明显加重，无法正常工作。