口腔溃疡可以使用局部用药来缓解症状，比如西瓜霜喷剂，一般喷后1~2天能感觉到疼痛减轻。
局部外用药
口腔溃疡散：主要成分有青黛、白矾、冰片等，能起到清热敛疮的作用，直接撒在溃疡面上，对缓解口腔溃疡的疼痛有一定效果。复方氯己定含漱液：可以杀菌消炎，每次含漱10~30秒，一天含漱3~4次，能减少口腔内的细菌滋生，促进溃疡愈合。
促进愈合类药物
重组人表皮生长因子凝胶：能促进口腔黏膜上皮细胞的增殖、迁移，加快溃疡面的愈合，每天涂抹2~3次在溃疡处即可。维生素类药物：如维生素B2，当人体缺乏维生素B2时容易引发口腔溃疡，适当补充维生素B2可能有助于预防和辅助治疗口腔溃疡，一般成人每天补充量在5~10毫克。
针对病因的药物
如果是缺乏微量元素引起的口腔溃疡，可补充锌制剂：比如葡萄糖酸锌口服液，一般成人每次服用10毫升左右，一天2次，但儿童服用需在医生指导下调整剂量，因为锌元素摄入过多也会对身体有不良影响。如果是自身免疫因素导致的口腔溃疡，可能会用到免疫调节剂：如转移因子口服液，它可以调节免疫功能，但用药需严格遵循医嘱，因为不同病情的用量和疗程都不同。