掏耳朵后里面疼可能是多种原因导致的。一般来说，常见原因包括外耳道皮肤损伤、外耳道感染等，大约有30%左右的人在不当掏耳后会出现耳部疼痛情况。
外耳道皮肤损伤导致疼痛
挖耳工具过尖过锐： 如果使用棉签、发卡等较尖锐的工具掏耳朵，很容易刮伤外耳道皮肤。比如用比较尖锐的棉签头去掏耳朵，就可能直接划破外耳道的皮肤，从而引起疼痛。这种损伤一般会有局部的刺痛感，伤口较轻时可能仅有轻微疼痛并伴有少量出血。用力过度： 掏耳朵时用力过猛，也会造成外耳道皮肤损伤而疼痛。比如有些人掏耳朵时特别用力，像用较大的力气把棉签往耳朵里捅，就容易损伤外耳道皮肤，导致疼痛出现，可能疼痛程度相对较明显，尤其是用力较大时。
外耳道感染引发疼痛
细菌性感染： 掏耳朵后如果外耳道皮肤破损，细菌容易侵入引发感染。常见的细菌如金黄色葡萄球菌等，感染后会导致外耳道红肿、疼痛，可能还会有分泌物增多的情况。比如原本外耳道皮肤有小的破损，之后接触到细菌，就可能引发细菌性感染，出现疼痛且局部可能有炎症表现。真菌性感染： 长期处于潮湿环境或者频繁掏耳破坏外耳道正常菌群，容易引发真菌性外耳道炎。掏耳后真菌趁机感染，会引起耳部瘙痒、疼痛，耳朵里可能有白色或者黄色的分泌物，像霉菌样的东西。例如在浴室长时间停留后掏耳，就容易诱发真菌性感染导致疼痛。
鼓膜受到影响导致疼痛
误碰鼓膜： 掏耳朵时不小心碰到鼓膜，也会引起疼痛。鼓膜比较脆弱，当掏耳工具触碰到它时，会产生较为明显的刺痛感，可能还会伴有短暂的耳鸣等情况。比如使用较细的耳勺掏耳时，没控制好深度碰到鼓膜，就会立刻感到耳部疼痛。引发鼓膜充血： 频繁掏耳或者用力掏耳可能导致鼓膜充血，进而引起疼痛。长期反复掏耳刺激鼓膜，会使鼓膜处于充血状态，出现疼痛不适，可能还会影响听力，感觉耳朵发闷等。