早上起来肚子疼通常可能是以下原因导致。
一、受凉：这主要是由于患者晚上睡觉时腹部受了凉。腹部受凉会使腹部内壁血管收缩，引发痉挛，从而出现早上起来肚子疼的情况。
二、肠道菌群失调：在肠道菌群失调时，会让患者肠道蠕动的速度变快，这样就会有早上起来肚子疼的表现。同时，还可能因肠道菌群失调而出现便秘、腹泻、口臭等症状。
三、急性肠胃炎：如果患者在前一天吃了不干净的食物或刺激性食物等，就会因为细菌或病毒等的刺激而产生肚子疼的症状。而且，还可能伴随有恶心、呕吐、腹泻等情况。此外，像缺血性肠病等其他情况也会致使患者早上起来肚子疼。所以，建议患者出现这种症状后要及时就医检查，明确病因，然后在医生的指导下进行相应的处理。
总结：早上起来肚子疼可能由多种原因引起，包括受凉、肠道菌群失调、急性肠胃炎以及其他一些疾病。一旦出现该症状，应及时就医明确原因并妥善处理。