脸上长扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 3型等亚型病毒。一般来说，当皮肤有细微破损时，病毒就容易入侵并感染上皮细胞，从而引发扁平疣。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接握手等接触行为，就有可能让病毒从患者传染到健康人身上。如果健康人的皮肤有破损，感染风险会更高。间接接触传播： 接触被患者污染的物品，像共用毛巾、脸盆等，也可能感染病毒。比如在公共浴室使用了患者用过的毛巾，就有感染扁平疣的可能。
易发人群特点
免疫力较低者： 例如长期熬夜、营养不良、患有慢性疾病（如糖尿病等）的人，身体免疫力下降，更容易受到HPV病毒的侵袭而长扁平疣。像一些经常熬夜加班的上班族，由于休息不足，免疫力相对较弱，就比作息规律的人更易长扁平疣。青少年群体： 青少年的皮肤比较娇嫩，而且免疫系统还在发育中，相对更容易感染HPV病毒引发扁平疣。据统计，青少年患扁平疣的概率比其他年龄段人群相对高一些。
皮肤状况与发病关系
皮肤屏障功能差者： 皮肤本身比较敏感、干燥，或者有脂溢性皮炎等皮肤问题的人，皮肤屏障功能受到破坏，病毒更容易侵入。比如患有脂溢性皮炎的人，皮肤状态不佳，此时接触到HPV病毒就更易长扁平疣。经常搔抓皮肤者： 如果经常用手搔抓脸部皮肤，容易造成皮肤破损，为HPV病毒的入侵打开“大门”，进而引发扁平疣。所以要尽量避免用手频繁搔抓脸部皮肤。