脸上长扁平疣主要由人乳头瘤病毒感染导致，此外，长期的日光照射、免疫系统功能低下等也可诱发扁平疣。
一、人乳头瘤病毒感染：人乳头瘤病毒会通过皮肤的破损处感染表皮细胞，进而引起皮肤病变。而且这种病毒还能通过皮肤破损进行自身传染，这就会致使脸上长出扁平疣。
二、日光照射：若长期遭受日晒，会使皮肤抵抗力减弱。倘若本身就存在扁平疣，人乳头瘤病毒便会大量繁殖。要是脸上的皮肤出现日晒伤，就有可能因自身传染而引发脸上长扁平疣。
三、免疫系统功能低下：当患者为艾滋病病毒携带者、艾滋病患者，或者由于身体出现感冒、发热以及过度劳累、内分泌失调等状况而导致抵抗能力下降时，如果受到人乳头瘤病毒感染，由于身体无法有效抵御病毒，就会造成感染从而诱发脸上长扁平疣。
总之，脸上长扁平疣与多种因素有关，人乳头瘤病毒感染是主要原因，而长期日光照射和免疫系统功能低下等也是重要的诱发因素。